Hipothalamus memiliki fungsi sebagai pusat himpunan informasi mengenai keadaan tubuh sejahtera dan selanjutnya sebagian besar informasi ini digunakan untuk mengatur sekresi kelenjar hipofisis. Jadi apabila terjadi kerusakan pada hypothalamus maka hypothalamus akan kehilangan fungsinya dan mengalami gangguan pada pengaturan sekresi kelenjar hipofisis. (Guyton, Fisiologi Manusia)

Contoh penyakit yang ditimbulkan akibat kerusakan hypothalamus

·         Hipertiroidisme

·         Sindrom Cushing

·         Diabetes mellitus

·         Anoreksia nervosa dengan amenorea fungsional

(S. Budihalim, D. Sukatman, Ilmu Penyakit Dalam)